2000年01月05日
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将苏州市郊区更名为虎丘区。
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2000年12月21日
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撤销江宁县，设立南京市江宁区。
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2000年12月21日
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撤销邗江县，设立扬州市邗江区。
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2000年12月21日
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将地级淮阴市更名为地级淮安市。撤销县级淮安市、淮阴县，分别设立楚州区、淮阴区。
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2000年12月21日
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撤销县级锡山市，设立无锡市锡山区、惠山区。撤销无锡市马山区，且将无锡市郊区更名为滨湖区。
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2000年12月31日
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撤销县级吴县市，设立苏州市吴中区、相城区。
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2001年10月01日
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撤销连云港市云台区。
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2002年04月03日
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撤销县级武进市，设立常州市武进区。且将常州市郊区更名为新北区。
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2002年04月03日
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撤销南京市浦口区和江浦县，设立新的南京市浦口区。且将撤销南京市大厂区和六合县，设立南京市六合区。
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2002年04月03日
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撤销丹徒县，设立镇江市丹徒区。
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2002年11月11日
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将扬州市郊区更名为维扬区。(民政部批复)
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2003年12月18日
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撤销盐都县，设立盐城市盐都区。且将盐城市城区更名为亭湖区。
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2004年01月15日
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撤销丹徒县，设立镇江市丹徒区。
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2009年03月23日
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撤销县级通州市，设立南通市通州区。
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2010年09月05日
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撤销徐州市九里区。撤销铜山县，设立徐州市铜山区。
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2011年10月22日
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撤销县级江都市，设立扬州市江都区。并且撤销维扬区。
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2011年12月30日
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将淮安市楚州区更名为淮安区。(民政部批复)
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2012年08月17日
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撤销苏州市沧浪区、平江区、金阊区，设立苏州市姑苏区。撤销县级吴江市，设立苏州市吴江区。
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2012年12月17日
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撤销县级姜堰市，设立泰州市姜堰区。
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2013年02月08日
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撤销南京市秦淮区和白下区，设立新的南京市秦淮区。撤销南京市鼓楼区和下关区，设立新的南京市鼓楼区。撤销溧水县，设立南京市溧水区。撤销高淳县，设立南京市高淳区。
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2014年05月02日
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撤销连云港市新浦区和海州区，设立新的连云港市海州区。撤销赣榆县，设立连云港市赣榆区。
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2015年04月28日
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撤销常州市武进区和戚墅堰区，设立新的常州市武进区。撤销县级金坛市，设立常州市金坛区。
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